Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Naa38-204ENSMUST00000144531 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm5292-201ENSMUST00000073317 580 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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AtrxQ61687 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Cbx3-ps5-201ENSMUST00000091545 544 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Cbx3-ps2-201ENSMUST00000099421 544 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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