Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Cln3Q61124 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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Cln3Q61124 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Cln3Q61124 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Cln3Q61124 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Cln3Q61124 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Cln3Q61124 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Cln3Q61124 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Cln3Q61124 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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Cln3Q61124 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Cln3Q61124 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Cln3Q61124 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cln3Q61124 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms