Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbbp7Q60973 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms