Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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