Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms