Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Chid1-209ENSMUST00000166082 4222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d24-202ENSMUST00000040474 6269 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Adgrd1-201ENSMUST00000056617 5163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Arid5b-204ENSMUST00000219238 7581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Vps8-206ENSMUST00000118923 4838 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Frmpd1-201ENSMUST00000044773 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
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Trappc1Q5NCF2 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Aff1-202ENSMUST00000054979 8323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
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Trappc1Q5NCF2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 2900060N12Rik-201ENSMUST00000221412 3721 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Rnf165-201ENSMUST00000026494 7300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
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Trappc1Q5NCF2 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
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Trappc1Q5NCF2 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
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Trappc1Q5NCF2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Tns1-201ENSMUST00000169786 9966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
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