Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Trim58Q5NCC9 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim58Q5NCC9 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim58Q5NCC9 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim58Q5NCC9 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim58Q5NCC9 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim58Q5NCC9 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim58Q5NCC9 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim58Q5NCC9 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trim58Q5NCC9 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trim58Q5NCC9 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trim58Q5NCC9 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trim58Q5NCC9 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trim58Q5NCC9 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trim58Q5NCC9 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trim58Q5NCC9 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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