Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA7

Snx33, Sorting nexin-33, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx33Q4VAA7 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx33Q4VAA7 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx33Q4VAA7 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx33Q4VAA7 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx33Q4VAA7 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx33Q4VAA7 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx33Q4VAA7 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx33Q4VAA7 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx33Q4VAA7 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx33Q4VAA7 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx33Q4VAA7 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx33Q4VAA7 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx33Q4VAA7 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx33Q4VAA7 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx33Q4VAA7 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx33Q4VAA7 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx33Q4VAA7 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx33Q4VAA7 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx33Q4VAA7 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx33Q4VAA7 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx33Q4VAA7 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx33Q4VAA7 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx33Q4VAA7 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx33Q4VAA7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx33Q4VAA7 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx33Q4VAA7 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx33Q4VAA7 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx33Q4VAA7 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx33Q4VAA7 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx33Q4VAA7 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx33Q4VAA7 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx33Q4VAA7 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx33Q4VAA7 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx33Q4VAA7 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Snx33Q4VAA7 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Snx33Q4VAA7 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Snx33Q4VAA7 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Snx33Q4VAA7 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Snx33Q4VAA7 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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