Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Trp53i11Q4QQM4 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Trp53i11Q4QQM4 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Trp53i11Q4QQM4 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Trp53i11Q4QQM4 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Trp53i11Q4QQM4 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trp53i11Q4QQM4 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trp53i11Q4QQM4 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Trp53i11Q4QQM4 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Trp53i11Q4QQM4 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Trp53i11Q4QQM4 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Trp53i11Q4QQM4 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Trp53i11Q4QQM4 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trp53i11Q4QQM4 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trp53i11Q4QQM4 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trp53i11Q4QQM4 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trp53i11Q4QQM4 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trp53i11Q4QQM4 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trp53i11Q4QQM4 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trp53i11Q4QQM4 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trp53i11Q4QQM4 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trp53i11Q4QQM4 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trp53i11Q4QQM4 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Trp53i11Q4QQM4 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trp53i11Q4QQM4 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Trp53i11Q4QQM4 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trp53i11Q4QQM4 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trp53i11Q4QQM4 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Trp53i11Q4QQM4 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trp53i11Q4QQM4 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trp53i11Q4QQM4 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trp53i11Q4QQM4 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trp53i11Q4QQM4 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trp53i11Q4QQM4 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trp53i11Q4QQM4 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Trp53i11Q4QQM4 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trp53i11Q4QQM4 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trp53i11Q4QQM4 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
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Trp53i11Q4QQM4 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trp53i11Q4QQM4 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
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