Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms