Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms