Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms