Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms