Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms