Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ctdnep1Q3TP92 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ctdnep1Q3TP92 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ctdnep1Q3TP92 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ctdnep1Q3TP92 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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