Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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