Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Gm15033-201ENSMUST00000118188 673 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Gm15132-201ENSMUST00000118581 652 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Actg2-202ENSMUST00000121731 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Gm16013-201ENSMUST00000152249 353 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Gm28391-201ENSMUST00000185202 379 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Gm29528-201ENSMUST00000186699 379 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Gm29526-201ENSMUST00000187217 379 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Gm44460-201ENSMUST00000196179 129 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Zfp389-202ENSMUST00000224437 1234 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Col24a1Q30D77 Fut8-202ENSMUST00000171770 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Ccdc65-201ENSMUST00000003444 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Gm8809-201ENSMUST00000119367 743 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Gm11770-201ENSMUST00000135048 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Faap24-203ENSMUST00000154597 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Gm5627-201ENSMUST00000178539 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Rps27-202ENSMUST00000195998 458 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Phf5a-201ENSMUST00000023117 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 3110001I22Rik-201ENSMUST00000035426 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Gm24066-201ENSMUST00000104515 131 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Ppih-205ENSMUST00000106321 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Gm13215-201ENSMUST00000117559 472 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Gm8864-201ENSMUST00000118653 1010 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Gm44805-201ENSMUST00000127648 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Gm12796-201ENSMUST00000131864 344 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Rpl17-ps11-201ENSMUST00000161946 729 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Ighv1-8-201ENSMUST00000192236 293 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Gm37486-201ENSMUST00000195663 405 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Gm43851-201ENSMUST00000200726 327 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Gm43450-201ENSMUST00000202611 632 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Gm45225-201ENSMUST00000206852 1139 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 Gm18504-201ENSMUST00000220917 929 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 AC132881.1-201ENSMUST00000223780 1062 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Col24a1Q30D77 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms