Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Samd11Q1RNF8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms