Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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