Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms