Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Olfr1280-201ENSMUST00000082167 1003 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Csnka2ip-201ENSMUST00000089279 1336 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Tex9-214ENSMUST00000184831 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm15780-201ENSMUST00000121283 935 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 1700060C16Rik-201ENSMUST00000150559 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm44688-201ENSMUST00000209083 537 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Olfr815-201ENSMUST00000071557 951 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Fancd2os-201ENSMUST00000035870 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 AC139754.3-201ENSMUST00000220444 1627 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Olfr1012-201ENSMUST00000099916 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms