Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm9929-201ENSMUST00000171747 1671 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms