Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms