Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gjb5Q02739 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms