Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms