Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
F8a1Q00558 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms