Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stx2Q00262 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms