Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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