Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ptprn2P80560 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ptprn2P80560 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ptprn2P80560 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ptprn2P80560 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ptprn2P80560 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ptprn2P80560 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ptprn2P80560 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ptprn2P80560 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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Ptprn2P80560 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ptprn2P80560 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ptprn2P80560 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ptprn2P80560 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Ptprn2P80560 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Ptprn2P80560 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Ptprn2P80560 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ptprn2P80560 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Ptprn2P80560 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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Ptprn2P80560 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Ptprn2P80560 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
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Ptprn2P80560 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Ptprn2P80560 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Ptprn2P80560 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms