Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Hoxd13P70217 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Hoxd13P70217 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Hoxd13P70217 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Hoxd13P70217 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Hoxd13P70217 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms