Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Copz1P61924 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Copz1P61924 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Copz1P61924 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Copz1P61924 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms