Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Samsn1P57725 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms