Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp25P57080 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp25P57080 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp25P57080 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp25P57080 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp25P57080 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms