Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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