Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acod1P54987 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acod1P54987 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Acod1P54987 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acod1P54987 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Acod1P54987 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Acod1P54987 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Acod1P54987 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acod1P54987 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acod1P54987 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acod1P54987 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acod1P54987 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acod1P54987 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Acod1P54987 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acod1P54987 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acod1P54987 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Acod1P54987 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acod1P54987 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acod1P54987 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acod1P54987 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acod1P54987 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acod1P54987 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acod1P54987 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Acod1P54987 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Acod1P54987 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Acod1P54987 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Acod1P54987 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Acod1P54987 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Acod1P54987 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Acod1P54987 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Acod1P54987 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Acod1P54987 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Acod1P54987 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Acod1P54987 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Acod1P54987 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Acod1P54987 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Acod1P54987 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Acod1P54987 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Acod1P54987 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Acod1P54987 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Acod1P54987 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Acod1P54987 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Acod1P54987 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Acod1P54987 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Acod1P54987 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Acod1P54987 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Acod1P54987 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Acod1P54987 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Acod1P54987 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Acod1P54987 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Acod1P54987 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Acod1P54987 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Acod1P54987 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Acod1P54987 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Acod1P54987 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Acod1P54987 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Acod1P54987 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Acod1P54987 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Acod1P54987 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Acod1P54987 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Acod1P54987 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Acod1P54987 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Acod1P54987 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Acod1P54987 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Acod1P54987 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Acod1P54987 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Acod1P54987 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Acod1P54987 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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