Protein–RNA interactions for Protein: P51859

Hdgf, Hepatoma-derived growth factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HdgfP51859 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HdgfP51859 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HdgfP51859 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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HdgfP51859 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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HdgfP51859 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HdgfP51859 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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HdgfP51859 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HdgfP51859 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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HdgfP51859 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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HdgfP51859 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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HdgfP51859 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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HdgfP51859 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HdgfP51859 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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HdgfP51859 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HdgfP51859 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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HdgfP51859 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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HdgfP51859 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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HdgfP51859 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HdgfP51859 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HdgfP51859 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HdgfP51859 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HdgfP51859 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms