Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
TspoP50637 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
TspoP50637 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
TspoP50637 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
TspoP50637 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TspoP50637 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TspoP50637 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
TspoP50637 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TspoP50637 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TspoP50637 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
TspoP50637 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
TspoP50637 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
TspoP50637 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
TspoP50637 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
TspoP50637 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
TspoP50637 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
TspoP50637 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
TspoP50637 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TspoP50637 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms