Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc13P50207 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc13P50207 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc13P50207 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc13P50207 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc13P50207 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc13P50207 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc13P50207 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc13P50207 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc13P50207 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc13P50207 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc13P50207 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc13P50207 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc13P50207 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc13P50207 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Hoxc13P50207 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Hoxc13P50207 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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