Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GdnfP48540 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
GdnfP48540 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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