Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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