Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SrprbP47758 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrprbP47758 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrprbP47758 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrprbP47758 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SrprbP47758 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrprbP47758 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SrprbP47758 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SrprbP47758 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms