Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cdkn1bP46414 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms