Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
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