Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PpargP37238 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PpargP37238 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PpargP37238 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PpargP37238 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PpargP37238 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PpargP37238 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PpargP37238 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms