Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Acmsd-201ENSMUST00000038006 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gm26797-202ENSMUST00000213132 2562 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Mcf2-204ENSMUST00000228150 3336 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Dlgap2-208ENSMUST00000150247 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Grpr-201ENSMUST00000033730 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Tacc2-208ENSMUST00000207549 3492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Sh2d7-201ENSMUST00000060242 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 2810029C07Rik-201ENSMUST00000180698 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms