Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VtnP29788 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VtnP29788 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VtnP29788 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VtnP29788 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms