Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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Pabpc1P29341 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pabpc1P29341 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pabpc1P29341 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pabpc1P29341 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pabpc1P29341 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pabpc1P29341 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pabpc1P29341 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pabpc1P29341 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pabpc1P29341 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pabpc1P29341 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pabpc1P29341 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pabpc1P29341 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pabpc1P29341 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pabpc1P29341 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Pabpc1P29341 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pabpc1P29341 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pabpc1P29341 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pabpc1P29341 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pabpc1P29341 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pabpc1P29341 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pabpc1P29341 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pabpc1P29341 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pabpc1P29341 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Pabpc1P29341 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pabpc1P29341 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pabpc1P29341 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pabpc1P29341 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pabpc1P29341 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pabpc1P29341 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pabpc1P29341 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pabpc1P29341 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pabpc1P29341 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pabpc1P29341 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pabpc1P29341 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pabpc1P29341 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pabpc1P29341 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pabpc1P29341 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pabpc1P29341 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pabpc1P29341 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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