Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrgP28705 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RxrgP28705 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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