Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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