Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd8P23463 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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